完美的稽查執(zhí)法流程，是新《海關(guān)稽查條例》《〈海關(guān)稽查條例〉實(shí)行方法》的重要亮點(diǎn)。新《海關(guān)稽查條例》《〈海關(guān)稽查條例〉實(shí)行方法》通過科學(xué)的流程設(shè)計(jì)，可有效防止執(zhí)法人員不作為、亂作為。主要流程包含：

一是完美查告訴制度。新《海關(guān)稽查條例》《〈海關(guān)稽査條例〉實(shí)行方法》規(guī)定的告訴內(nèi)容包含告訴稽查的實(shí)行、告訴被稽查人的權(quán)力、告訴稽查結(jié)論，同時(shí)還特殊規(guī)定發(fā)覺被稽查人涉嫌違法或者少征、漏征稅款的，應(yīng)該書面征求被稽查人看法，充分保障了被稽查人的知情權(quán)、論述權(quán)、申辯權(quán)以及追求法律救援等權(quán)力。

二是明白躲避制度。新《海關(guān)稽查條例》規(guī)定，海關(guān)進(jìn)行稽查時(shí)，海關(guān)工作人員與被稽查人有直接利害關(guān)系，應(yīng)該躲避；新《〈海關(guān)稽查條例）實(shí)行方法》對(duì)躲避制度進(jìn)行細(xì)化規(guī)定，確保躲避制度落到實(shí)處。

三是強(qiáng)化監(jiān)視制約機(jī)制。新《海關(guān)稽查條例》明晰了內(nèi)部層級(jí)核批制度，將海關(guān)行使重大稽查職權(quán)的內(nèi)部核批由“經(jīng)海關(guān)關(guān)長(zhǎng)同意”明白規(guī)定為“經(jīng)直屬海關(guān)關(guān)長(zhǎng)或者其授權(quán)的附屬海關(guān)關(guān)長(zhǎng)同意”，同時(shí)還提高完美了海關(guān)稽查執(zhí)法資歷制度和雙人作業(yè)制度等，規(guī)范執(zhí)法行為，強(qiáng)化監(jiān)視制約。